パイオニア台車の車両と他の台車の車両との連結運転には問題があったようで、1996年以降に実施された更新修繕の際、7100系や泉北100系、3000系の廃車発生品(または一部新製)のS型ミンデン台車への換装が行われました。この台車交換作業が行われた際に6300系への改番が実施され、6000系や6200系と併結運転が行われるようになっています。
6100系は1973年までに76両が製造され、2009年度までに全76両が6300系化されました。現在は6連8本、4連4本、2連6本に組成され、全車が高野線で活躍中です。